任丽丽|任丽丽教授：呼吸系感染性疾病的精准诊断丨CACP 2021
编者按
任丽丽教授和她的团队最早发现新冠病毒，在国内首批建立新冠病毒病原检测方法，疫情早期最早提出联合抗体检测显著提升新冠病例诊断率，也是率先提出食品冷链可能是病毒新型传播载体的团队 。在2021 CACP年会中，任丽丽教授就呼吸系感染性疾病的病原学诊断的现状做出了分析，通过对急性呼吸道感染病例病毒组成谱和检出率的研究，对未来病原病因学的精确诊断技术做出了展望 。
以下是《呼吸界》小编整理的任丽丽教授的发言，在此分享给大家！
在最新发布的全球高疾病负担排行榜上看出，呼吸道感染仍然位于全球死因的前列（如图1） 。引起呼吸道感染的病原具有种类多、变异频、含量低的特点，往往还存在复杂的共感染[1]，使得呼吸道感染的病原检测诊断难度较大 。因此，呼吸系感染性疾病的病原学诊断一直是呼吸系感染性疾病领域的重点和难点问题 。
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图4
门诊患者常见的呼吸道病毒感染种类包括流感病毒（IFVs A/B/C）、副流感病毒（HPIVs1/2/3/4）、呼吸道合胞病毒（RSV-A/B）、人冠状病毒（HCoVs），人偏肺病毒（hMPV）、博卡病毒（HBoV）、腺病毒（HAdVs）和鼻病毒（HRVs） 。
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我们把能够感染人类呼吸道的病毒分属于7个科，28种属 。在迄今入组的1万余呼吸道感染数据中，能够检测到上述所有科属病毒的流行 。
（二）门诊急性呼吸道感染病毒检出情况
在门诊病例中，共有61%病例多病原检测结果为阴性（如图5） 。在所有检出的病毒中，IFVA/B占据了67%[9]，这组数据支持前文提到的对门诊病例首要推荐检测IFVs 。如果同时检测IFVs和EVs，或IFVs+EVs+RSV，则占阳性检出的92%[10] 。上述研究发现提示，在门诊病例病原学诊断中，是否通过分类检测的方式，在可控的收费情况下，更大程度的获取阳性检出结果，是否可增加病人收益，还需要进行更严谨的研究设计来给出科学依据 。
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图5
（三）门诊和住院呼吸道感染病例病原谱差异显著
分析儿童的呼吸道感染病原学数据（如图6），我们发现儿童呼吸道感染门诊和住院患者病原的分布差异显著，RSV在住院的病例中检出率较高，而IFVs在门诊病例中检出率更高 。经过归因分析，HAdvs和RSV单独感染、IFVs+RSV共感染是患儿住院的危险因素 。
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图6
（四）国外成人CAP常见呼吸道感染病原的检出
2021年的《自然综述- Disease Primers》杂志发表的一篇综述指出成人CAP患者中IFVs、HRVs和肺炎链球菌检出率最高[11]（如图7） 。
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图7
2015年《新英格兰医学杂志》报道了美国CAP病例病原学数据（如图8），显示病原检出率最高的是HRVs，其次是IFVs，病毒的检出率高于细菌[12] 。我们的数据则显示，国内呼吸道感染多病原中细菌检出率高于病毒，可见不同国家呼吸道感染的病原谱的差异比较大 。提示在本土病原学研究的基础上，针对性地建立呼吸道感染病原检测策略 。
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图8
（五）小结
1、呼吸道感染病例门诊和住院病原谱组成特征提示可开展病原学的分级诊断；
2、门诊病例，是否可建立基于年龄的病原分级检测；
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