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蛋白质三级结构预测分析软件

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二级结构预测 三级结构预测同源建模:需要同源蛋白三级结构作为基础预测 。蛋白质结构可以进行预测，-2蛋白质(1)氨基酸的序列决定了蛋白质的一级结构，蛋白质的一级结构是了解蛋白质的结构、作用机制和生理功能的必要基础 。
1、B细胞表位 预测的方法及应用?线性表位预测方法:B细胞表位的预测方法主要以线性表位为主，预测B细胞表位的大量算法都是基于蛋白质序列 。这些算法包括:蛋白质亲水性算法、蛋白质可塑性算法、蛋白质二级结构预测算法、蛋白质抗原性算法 。这些方法的代表软件有PEOPLE、PREDITOP、BEPITOPE、Bcepred、ABCpred、BepiPred、APP等 。
2、用PUBMED搜索这个氨基酸序列对应的 蛋白质你可以先用这个核苷酸序列做个blast，找出对应的基因和蛋白质 。Blast可在NCBI网站上获得 。你可以用blastx来比较蛋白质和核苷酸序列 。然后就可以找到你想要的蛋白质序列了 。如果有人有结果结构，可以在RCSB上查一下 。如果一直不是结果结构，你应该找一些预测 软件让我们看看三级结构 。希望能领养 。
3、如何使用psipred 蛋白质序列 分析工作台 蛋白质结构研究方法进展结构酵母的X射线晶体学、核磁共振衍射、电子显微镜、质谱、荧光共振能量转移(FRET)、同源建模预测 蛋白质双杂交和三杂交COIP双向电泳已被开发 。由于结构预测技术本身的限制 ， 每个预测服务都有自己的优缺点 。
4、...想问一下一个名词,什么叫“ 蛋白质 三级结构的数据库”? 蛋白质结构可以进行预测 。通过知道氨基酸序列，计算出预测 蛋白质的二级结构和空间三维结构 。目前，保存在蛋白质结构数据库PDB中的蛋白质的三维结构主要采用X射线晶体衍射和核磁共振成像技术，对蛋白质的结构检测比序列检测困难得多 。蛋白质 三级结构数据库是生物信息学的内容 。简单来说 ， 氨基酸序列的空间构象(三级结构)是已知的 。如果另一个蛋白质分子含有这个氨基酸序列，就可以大致推断出这个蛋白质的空间构象(三级结构) ， 由下式确定
5、 蛋白质简介目录1拼音2英文参考3概述4生化性质5 蛋白质历史6 蛋白质分类7 蛋白质功能7.1催化7.2信号转导和配体转运7.3营养8人体-2生理功能8.1构成和修复人体组织8.2构成酶和激素8.3构成抗体8.4调节渗透压8.5 外链模拟12 13参考1拼音dànbáizhì2英文参考蛋白质结构预测有意义，因为通过实验确定结构还是比通过实验确定序列慢很多 。预测的结构有助于我们理解蛋白质的功能和机制 ， 对合理的药物设计也有重要意义 。(理论基础)蛋白质结构在进化上比蛋白质序列保守得多 。蛋白质可以自发地折叠成它们的天然结构，因此蛋白质的折叠在一定程度上是在氨基酸序列中编码的 。而寻找蛋白质正确结构的过程，不可能是对所有可能性的随机搜索 。探究蛋白质的结构，了解如何折叠 ， 是一个非常科学的问题 。
6、 蛋白质的一二三四级结构(1)氨基酸的序列决定蛋白质: 蛋白质一级结构是了解蛋白质的结构、作用机制和生理功能的必要基础 。(2) 蛋白质分子的一个肽链的局部空间结构构成蛋白质: 蛋白质二级结构不涉及氨基酸残基侧链的构象 。构成二级结构的主要化学键是氢键 ， 二级结构包括:α螺旋、β折叠、β转角和无规卷曲 。
(3) 蛋白质 三级结构是指整个肽链中所有氨基酸残基的相对空间位置，即整个肽链中所有原子在三维空间中的排列位置 。蛋白质 三级结构的形成和稳定主要依靠疏水键等二级键 。蛋白质分子量大的往往可以折叠成几个结构紧凑稳定的区域，并且每个区域都有自己的功能，称为结构域 。
7、 蛋白质结构 预测与 分析常用网址(中蛋白质三级Structure预测方法:1 。同源模型2 。foldrecognition3 。从头计算方法同源模建的基本步骤:1 .模板选择；2.待测序列和模板序列之间的比较；3.模型的建立:①待测蛋白主链的构建；②线圈区域的建模；③侧链安装# SCWRL()，目前比较流行的侧链安装程序，4 。模型评估和周期细化 。
8、 蛋白质二级结构 预测 软件的推荐及具体介绍Modeler是a蛋白质structure预测软件:1)支持安装在windows平台上；2)支持基于多模板的建筑结构；3)优化后自带一套成型结构 ， 分析软件；官方介绍:蛋白质三维结构的同源或比较建模(1 ， 
9、 蛋白质结构的结构 预测【蛋白质三级结构预测分析软件】determination蛋白质的序列比蛋白质的结构要简单得多，而蛋白质的结构比序列能给出更多关于其作用机制的信息 。因此，使用了许多方法来提取序列预测结构 ， 二级结构预测 三级结构预测同源建模:需要同源蛋白三级结构作为基础预测 。线程方法“Abinitio”:只需要蛋白质 sequence就可以构造预测，因为计算量大，所以需要有超级计算机或者使用分布式计算，比如Rosetta@home 。

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