广东省疾控中心|全国各地发现的新冠变异病毒来自哪儿?

3月14日,据广东省疾控中心消息,广东省疾控中心于3月12日成功从两例境外输入新冠肺炎个案的鼻咽拭子中首次发现B.1.525尼日利亚突变株,病毒分离工作仍在进行中 。该两名病例均为境外输入的无症状感染者,在闭环管理中被发现,分别于2月21日、2月22日报告为无症状感染者,目前仍在医院接受集中医学观察 。
世界卫生组织在新一期全球新冠疫情周报中介绍,目前全球主要流行3种“需要关注”的变异新冠病毒,分别为去年9月在英国出现的B.1.1.7、去年8月在南非出现的B.1.351以及去年12月在巴西和日本出现的P.1 。截至3月9日,已报告出现这3种变异病毒的国家分别超过110、50和30个 。
上海:首次发现的新冠变异病毒来自英国
2020年12月30日,我国首次报告变异新冠病毒感染病例 。该病例曾从英国乘飞机返回上海,根据基因测序结果发现,该名患者带有此前在英国发现的变异病毒 。《中国疾控中心周刊》研究报告显示,该病例是一名23岁的女学生,12月14日检测出新冠病毒呈阳性,当晚被转移到医院隔离 。
流行病学调查显示,12月12日,即该病患飞回中国的前两天,新冠检测结果呈阴性 。中国日报报道称,其回忆自己在公园里跑步时没有戴口罩、等待登机时曾摘下口罩吃饭喝水,这些都可能导致自己被感染 。
广东省疾控中心|全国各地发现的新冠变异病毒来自哪儿?
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广东:输入变异病毒基因序列与英国高度相似
2021年1月2日,广东省疾控中心在一名英国输入新冠肺炎确认病例的咽拭子样本中发现了B.1.1.7突变株,与当时英国报道的变异病毒基因序列高度相似 。
广东省疾控中心对2020年9月以来广东省境外输入确诊病例、无症状感染者的样本进行了回顾性的基因测序分析 。2021年1月2日,广东省疾控中心在一名英国输入新冠肺炎确认病例的咽拭子样本中发现了B.1.1.7突变株,与近期英国报道的变异病毒基因序列高度相似 。
该病例为闭环管理的英国入境人员,系中国籍留学生 。2020年12月4日从英国入境广州,入境时检测其新冠病毒核酸为阴性 。2020年12月18日,在隔离点采样检测新冠病毒核酸为阳性,送广州市第八人民医院隔离治疗,诊断为确诊病例,临床分型为轻型 。
山东:首例新冠变异毒株与英国变异株序列高度同源
2021年1月4日,山东省疾病预防控制中心完成对青岛报告的1例英国输入病例样本全基因测序分析,经比对,与当时高度关注的英国变异株序列高度同源 。该病例为山东省第一例输入的新冠病毒VUI-202012/01突变体感染病例 。
山东省疾病预防控制中心病毒性传染病防制所所长寇增强介绍,省疾控中心对这一病例进行了新冠病毒全基因组测序,成功获取该病例全基因组序列,同参考序列比对分析,该输入病例序列为新冠病毒欧洲家系L2.1型,与近期高度关注的英国变异株序列(VUI-202012/01或B.1.1.7突变株)相比同源性达99.99% 。
广东:境外输入一例南非籍病例检测到南非突变株
2021年1月6日,广东省疾控中心成功从一例境外输入南非籍新冠肺炎病例的咽拭子中分离出501Y.V2南非突变株 。该病例为闭环管理的南非入境人员,南非籍,系航空公司飞行员 。501Y.V2南非突变株于2020年10月中旬首次在南非发现,2020年11月初起成为当地流行的主要毒株 。
501Y.V2南非突变株基因组序列与参考基因组Wuh01(序列号MN908947)相比,具有23个核苷酸变异位点,除了与英国突变株B.1.1.7亚型有相同的N501Y突变外,不同之处在于还包含了对病毒感染能力有潜在重要影响的S蛋白E484K和K417N两个关键位点的突变 。
北京:大兴区本地确诊病例与英国病毒变异株高度同源

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