重测序分析流程,mirna测序分析流程

从技术原理、数据库测序流程、信息分析 流程、研究常规四个方面详细介绍 。自动测序实际上已经成为DNA测序的主流分析 , 关于基因测序的一些问题!DNA测序的原理和方法DNA测序可分为手动测序和自动测序,手工测序包括Sanger双脱氧链终止法和MaxamGilbert化学降解法 。

1、有谁能详细说一下全基因组BisulfiteSequencing的 流程目前对基因甲基化的研究主要结合亚硫酸氢钠处理和PCR技术 , 可分为PCR(MethylationspecificPCR,MSP)和硫化物测序PCR (BSP) 。技术原理:DNA被亚硫酸氢盐硫化后,DNA双链中的“C”转化为“U”,通过后续的PCR将“U”转化为“T” 。

所以根据亚硫酸氢盐处理过的DNA模板设计引物时,先输入感兴趣的DNA序列,程序会显示两种序列:一种是输入的源DNA序列;另一个是硫化后的DNA序列 。除了CpG岛上的5甲基胞嘧啶(5mC)外,所有未甲基化的“C”都转化为“T” 。根据转化的序列,设计引物进行BSP和MSP 。1.MSP:DNA用亚硫酸氢钠处理后,所有未甲基化的胞嘧啶脱氨基,变成尿嘧啶 , 但甲基化的胞嘧啶没有 。

2、IonTorrent基因 分析仪——介绍及原理IonTorrent Gene分析仪器组成:IonTorrent与Illumina原理的主要区别:Illumina:荧光信号IonTorrent:电信号IonTorrent核心概念:核心概念:芯片就是测序仪特点:扩展性、简单性、快速半导体测序技术:IonTorrent的生化原理:如何快速直接的检测Ion Torrent:离子系列测序平台适用芯片及数据输出汇总:PGM芯片:314芯片:1.2 mwell s316芯片:6.1mwells

3、小白的生信笔记(11977年 , 英国化学家FrederickSanger发明了双脱氧链终止法 。这项技术和W.Gilbert发明的化学降解法被称为第一代测序技术 。Sanger测序使用DNA聚合酶来延伸与未确定序列的模板结合的引物 。直到掺入链终止核苷酸 。每个测序由一组四个独立的反应组成 , 每个反应包含所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP),并与有限量的不同双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)混合 。

【重测序分析流程,mirna测序分析流程】终点取决于反应中相应的双脱氧 。每个dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调节 , 从而可以得到一组几百到几千个碱基的链终止产物 。它们有相同的起点,但终止于不同的核苷酸 。用高分辨率变性凝胶电泳可分离出大小不同的片段,经凝胶处理后 , 用x光胶片放射自显影或非同位素标记法检测 。

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