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2、GATK-Read groups运行GATK时报错:Java . lang . illegalargumentexception:samplescannotbeempty这个问题在GATKForum中讨论过；IllegalArgumentException:samplescannotbeemptycalvalidatesam下有两种模式:verbose:检查100个错误后退出，并将错误输出到终端；SUMMARYL:输出结果是一个显示错误和警告数量的表格；问题出在bam文件missing _ read _ group请自动阻止警告结果；Bwa比较使用参数RbwaR 。英文原文查看测序时:样本建库完成同一泳道测序，readssets可定义为Readgroupreadssets通过对单独的独立库中的样本进行测序而获得的集合也属于不同的Readgroups；Read groups存在于SAM/BAM/CRAM文件中由一系列标记组成；这些标签代表测序中的一些技术特征；有了这些数据 。
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