病毒|新冠可写入人类基因组，成为永不灭亡的病毒？
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进一步 ， 实验人员使用靶向N的荧光团标记的寡核苷酸探针进行单分子RNA-FISH（smRNA-FISH） ， 以确认病毒N序列已整合至宿主基因组中及其转录水平 。结果显示 ， SARS-CoV-2感染的细胞显示了预期的N RNA胞质FISH信号 ， 这表明SARS-CoV-2 N RNA通过细胞内源性RT活性整合 。
3.SARS-CoV-2感染和细胞因子诱导的人类内源性LINE-1表达与逆转录整合相关
【病毒|新冠可写入人类基因组，成为永不灭亡的病毒？】众所周知 ， 人LINE-1元件是编码逆转录酶和支持蛋白的自主逆转座子 ， 也有助于非自主元件进行逆转座 。科研人员发现 ， 感染SARS-CoV-2后 ， LINE-1元件的表达在已发表的细胞RNA-Seq数据中显着上调 ， 并与嵌合阅读丰度相关 。使用LINE-1特异性引物进行的表达分析显示 ， 在SARS-CoV-2感染后 ， Calu3细胞中LINE-1的上调约3-4倍 。此外 ， 对Calu3细胞DNA的PCR分析显示 ， 感染后SARS-CoV-2 N序列可能会被激活的LINE-1逆转录酶逆向整合 。
科研人员进一步用来自髓样 ， 小胶质细胞或CAR-T细胞培养物的含细胞因子的条件培养基处理细胞 ， PCR结果发现内源性LINE-1表达有约2-3倍的上调表达 。以上结果表明 ， 在病毒感染或暴露于细胞因子的细胞中 ， LINE-1的表达受到诱导 ， 这揭示了SARS-CoV-2在人类细胞中逆向整合的分子机制 。
综上所述 ， SARS-CoV-2感染患者的培养细胞和原代细胞中存在由病毒融合至细胞序列的嵌合转录本 。SARS-CoV-2RNA可以通过LINE-1元件的逆转录酶（RT）或HIV-1 RT在人类细胞中被逆转录 ， 并且这些DNA序列可以整合到细胞基因组中并再次发生转录 。人内源性LINE-1表达是在SARS-CoV-2感染或暴露于细胞因子的培养细胞中被诱导的 ， 提示了患者SARS-CoV-2逆向整合的分子机制 。SARS-CoV-2感染的这一新颖特征解释了为什么患者在康复后仍可以继续产生病毒RNA ， 并提出了RNA病毒复制的新思路 。
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